No.1 08049854 「全図面PDF形式」では出力時にずらし量の設定ができませんが、 出力の「PDF形式」のずらし量の設定が自動で適用されているようです。 出力の「PDF形式」で何かしらずらし量を設定されたままでしたら、 そのXYオフセットの数値を編集すれば「全図面PDF形式」にも 反映されますので、この設定を見直してはいかがでしょうか?